乙肝病毒S基因編碼表面抗原（HBsAg）。HBsAg有重要的生物學(xué)意義，是乙肝疫苗的主要成分，是診斷乙肝病毒感染的重要依據(jù)。S基因區(qū)可分為S區(qū)、前S1區(qū)和前S2區(qū)3段，3段的5′端各有一個(gè)起始密碼子（AUG），但共用一個(gè)終止密碼子。翻譯的產(chǎn)物形成HBsAg的主蛋白（226氨基酸）、中蛋白（281氨基酸）和大蛋白（409氨基酸）。S基因區(qū)最重要的變異是α決定簇氨基酸145位點(diǎn)的變異，即145位氨基酸由甘氨酸突變?yōu)榫彼幔℅145R）。由于該位點(diǎn)的變異，使乙肝病毒表面抗原與抗-HBs的結(jié)合力下降，從而降低了乙肝表面抗體的作用。
由于S基因編碼HBsAg，其變異將給臨床帶來(lái)以下幾種情況：
?。?）HBsAg陰性仍有乙肝病毒感染
S基因變異后所表達(dá)的HBsAg不能被現(xiàn)在廣泛使用的一些試劑所測(cè)出，致使乙肝病毒仍然存在，但HBsAg出現(xiàn)陰性的情況，此時(shí)應(yīng)結(jié)合HBeAg檢查和乙肝病毒的基因檢查技術(shù)，方可得出正確的結(jié)論。
?。?）疫苗免疫預(yù)防失敗
使用野毒株HBsAg制備的血源性或基因工程乙肝疫苗所產(chǎn)生的抗HBs對(duì)一些變異株的HBsAg的親和力和中和作用明顯下降，從而可致使乙肝疫苗阻斷母嬰傳播和乙肝免疫球蛋白（HBIG）預(yù)防移植肝再感染乙肝病毒失敗。
?。?）致病性的改變
S基因變異株在乙肝病毒無(wú)癥狀攜帶者、急性肝炎、慢性肝炎、重癥肝炎、肝硬化和肝癌患者體內(nèi)均有發(fā)現(xiàn)，使病變程度加重，范圍增加。
?。?）HBsAg亞型的改變
由于核苷酸序列發(fā)生變異，會(huì)引起HBsAg亞型的改變，使病情復(fù)雜化。
