干擾素主要用于治療有HBV復制標志的慢性乙型肝炎病人，具體條件為：①乙型肝炎表面抗原（HBsAg）陽性（＞1∶32）者兼乙型肝炎e抗原（HBeAg）陽性者（P／N＞2.5以上），或乙型肝炎病毒去氧核糖核酸（HBV-DNA）陽性者。②半年內谷丙轉氨酶（ALT）反復異常者。③肝組織炎癥反應明顯或肝組織HBsAg與乙型肝炎核心抗原（HBcAg）免疫組織化學染色陽性者。④血白細胞在4×109／升以上，血小板高于50×109／升者。
然而干擾素也并非治療肝炎的萬能良藥，對有些病毒性肝炎病人卻并不適宜，如①母嬰垂直傳播的新生兒：這是因為宿主產(chǎn)生免疫耐受形成慢性攜帶狀態(tài)，故對抗病毒藥不敏感。換句話說，這類嬰兒體內干擾素產(chǎn)生正常，故不必再用外源性干擾素誘導激發(fā)。②3歲以內嬰幼兒經(jīng)水平傳播而感染者：此類病兒的免疫系統(tǒng)淋巴細胞受到侵犯，導致T淋巴細胞和B淋巴細胞功能缺陷，形成持續(xù)攜帶狀態(tài)，故抗病毒治療不如成人期感染者有效。③存在肝內整合HBV-DNA者：因此類藥物只能控制復制型的HBV-DNA，而少量整合型仍持續(xù)存在，一旦停藥，該型DNA作為模板而使病毒再復制。④男性同性戀者：因此類人免疫功能不正常，所以使用干擾素無效。
